一般来说，查重系统会对论文中的所有文本进行比对，包括正文、参考文献部分、引言、结论等。然而，在讨论查重率是否包括引用文献时，不同的查重工具可能会有不同的处理方式。大部分专业的查重工具会识别出哪些部分是直接引用的，并将这些引用文本排除在查重率计算之外。这是因为学术规范允许作者在其论文中适当引用他人的研究成果，但前提是要注明来源，并确保没有过度引用，保持自己的学术贡献和观点。
在一些情况下，如果引用内容没有按照正确的格式进行标注（如APA、MLA等），或者过去的文献被大段复制而没有进行有效的分析和总结，查重系统可能会将这些部分视为抄袭，而计入重复率。因此，正确引用文献是减少查重率的关键。学术界提倡“合理使用”的原则，即在保证自身话语权和独立思考的基础上，可以适当引述他人的观点。但过度依赖引用或未按照学术规范进行引用都会使得论文的原创性受到质疑。
针对学术查重，通常可以遵循以下几个主要原则，以降低查重率并提升文稿的学术质量：
2. 独立思考: 在撰写论文时，注重发挥自身的思考能力，尽可能用自己的语言对研究主题进行分析与阐述。即便是在引用前人研究时，也应提供自己的见解和阐释。3. 适度引用: 引用的内容需保持适度，过长的引用或大量的直接引用会导致论文的原创性下降，查重率随之增加。
4. 使用查重工具进行自查: 在提交论文前，可以使用查重软件进行预检，这样可以及时发现高重复率的部分，并进行修改。
总之，论文查重率中包含引用文献的部分，但引用文献的合理使用可以有效降低查重率。学术写作不仅要遵循学术规范，还需要保持个人的学术风格与思考。在撰写论文时，作者应平衡引用与原创的关系，确保研究的独立性与原创性，从而提高学术论文的质量。
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